A fotoszféra felett kb. 10 km vastagságban helyezkedik el. Magasabb hőmérsékletű, mint a fotoszféra. Jellemző tevékenysége a protuberancia. Ezek a Nap felszíne fölé emelkedő néhány 100 000 km-es hosszúságú gázoszlopok. Élettartamuk több hónap is lehet. A kromoszféréban időnként fényes foltok jelennek meg. Ezek a flerek, más néven napkitörések. Kialakulásukban a Nap mágneses terének van jelentősége. Napkitörés alkalmával nagy mennyiségű anyagi részecske (korpuszkula) dobódik ki a Napból, amelyek bizonyos idő után a Földet is elérik. Ilyenkor észlelhető a mágneses vihar és a sarki fény a Földön.